Het wezenlijke verschil tussen het gymnasium en het atheneum bestaat uit de extra vakken Grieks en Latijn. Dit houdt voor het gymnasium in dat de leerlingen tot en met het derde leerjaar onderwijs in beide talen volgen. Daarna kunnen zij kiezen voor Latijn of Grieks of voor beide talen. De klassieke talen hebben een grote algemeen vormende waarde. Daarbij komen Latijn en Grieks goed van pas bij studies zoals Talen, Rechten, Geschiedenis, Filosofie, Medicijnen en Theologie. Een volledige vwo-opleiding, inclusief gymnasium, is mogelijk op de locaties Bruggertstraat en Van der Waalslaan. Op de locatie Geessinkweg kunnen de eerste drie jaren van het vwo gevolgd worden. De locatie Bruggertstraat begint met het gymnasium in het eerste leerjaar en geeft een mogelijkheid ook in het tweede leerjaar in te stromen via een korte inhaalcursus. De locaties Van der Waalslaan en Geessinkweg beginnen met het gymnasium in het tweede leerjaar na een selectie in het eerste jaar.